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BD FACSAria Quick Guide 

 
Before Turning On The Instrument 
 

1.

 

Open the sheath tank and check the Sheath level, fill the tank with 1X Sheath Fluid 
using the Leinco 10X Preservative Free 

Clear Sort

 Sheath Fluid, DO NOT USE THE 

LEINCO 10X CLEAR FLOW SHEATH FLUID. 

 

2.

 

Disconnect the pressure line from the ethanol tank and connect it to the top of the 
sheath tank.  Disconnect the sheath line from the short yellow line with in-line filter 
on the ethanol tank.  Connect the sheath line to the short blue line with in-line filter 
on the top of the sheath tank.

 

3.

 

Disconnect the waste tank and empty the tank in the sink.  Reconnect the waste line 
and waste level probe into the fluidics cart. 

 

4.

 

Turn the instrument on by pressing the large green button.  Do not turn off/on any 
of the laser main button/dials.

 

 
Starting up 
 

1.

 

Open DIVA and log in with your own user name and password.  Watch the bottom 
right of the cytometer window 

for ‘Instrument connected’ status at the bottom of 

the Cytometer window.  If the computer cannot connect to the cytometer, do a hard 
reboot of both the instrument and computer making sure that the computer is 
turned on first

.  Once the instrument has connected, select ‘

Use CS

T Settings’

 from 

the CST mismatch window.

 

Note: 

Selecting 

‘Use CST Settings’ will 

revert pressure value to that of the 

selected configuration. Go to Cytometer > View Configurations to change.  

2.

 

Perform the Fluidic Startup 

under the ‘Cytometer’ menu

 as prescribed by the 

software.

 

3.

 

After the Fluidic Startup has been performed make sure to check that the voltage is 
off and open the sort chamber and wipe everything (walls, waste trough, charge 
plates) with kimwipes to decrease chance of arcing errors.

 

4.

 

Put the desired nozzle tip in place.  Place the nozzle tip in position with the o-ring 
facing up, close the locking lever to hold it in place. Choose the correct configuration 
in Cytometer>Configurations if necessary. Choose the correct sort setup in FACSDiva 
software (sort => sort setup => 70/100 micron) according to the selected nozzle tip 
from the sort menu if not done automatically.

 

5.

 

 Turn the stream on by clicking on the stream button (red X) at the top of the Break 
off Window, the stream button should show as a green checkmark once the stream 
is turned on.

 

6.

 

Make sure stream is straight in the Break Off window. Adjust the position of the 
waste stream to the centre of the waste aspirator by rotating the sort block (use hex 
tool to release the adjustment screw on left and right of the sort chamber).  If time 
allows, wait 30 minutes for the stream to completely stabilize.

 

7.

 

Close sorting chamber door and make sure screw is tight.

 

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